Даний принцип електролікування побудований на використанні сантиметрового і дециметрового хвильового діапазону, на підставі якого існує і класифікація мікрохвильового впливу відповідно до застосовуваної довжиною хвилі. Високочастотний електромагнітне поле, що генерується апаратом для мікрохвильової терапії, надає тепловий вплив в процесі перетворення електричної енергії в теплову, і нетепловое, що виникає як реакція організму на мікрохвилі.
Хвилі сантиметрового діапазону, що генеруються апаратом для мікрохвильової терапії, відрізняються невеликою глибиною проникнення. Вплив дециметрового типу, навпаки, має здатність до глибшого і рівномірному впливу на тканини – саме вони є більш ефективними.
Узагальнене дію мікрохвиль на організм людини можна охарактеризувати як знижує больовий синдром і спазматичні прояви, гіпоалергенні, стимулюючий імунну систему і опірність запальним процесам.
Апарати мікрохвильової терапії можуть застосовуватися також для стимулюючого впливу на ендокринну систему і нормалізації емоційного стану (усунення порушень сну, стресових станів, депресій, загальною нервозності).